U-CH1

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Características gerais

Idade: 56 anos
Gênero: Masculino
Origem da doença: Sacral
Status da doença: Recorrente
Radiação prévia: Sim
Terapia sistêmica prévia: Não
Fonte: Silke Bruderlein, Peter Moller
Universidade de Ulm

Características moleculares

Morfologia celular: Fisalífera
Expressão de TBXT: Positiva; 10 vezes maior que a do U-CH2 com superexpressão, mas sem amplificação
Localização da TBXT: Nuclear
Expressão de CD24: Positiva; 13 vezes maior que a de U-CH2
Tipo de HLA: A2
Dados de sequência:

Dados de WGS, exoma e transcriptoma disponíveis: dados brutos de sequenciamento no Cavatica (Chordoma Foundation Dataset) e dados resumidos no PedcBioPortal. Entre em contato com researchteam@chordoma.org em caso de dúvidas.
Status do SMARCB1: Tipo selvagem
Resultados da validação: Relatório de validação

Condições de crescimento

Meio de crescimento: IMDM: RPMI-1640 (4:1) +10% FBS
Meio de congelamento: 70% de meio de crescimento completo suplementado com 20% de soro fetal bovino e 10% de DMSO
Condições de cultura: Temperatura: 37°C
Atmosfera: ar, 95%; dióxido de carbono (CO2), 5%
Instruções de subcultura: Procedimentos de cultura de células

Publicações

Caracterizado por:
  • Scheil S, Brüderlein S, Liehr T, Starke H, Herms J et al. (2001) Genome-wide analysis of sixteen chordomas by comparative genomic hybridization and cytogenetics of the first human chordoma cell line, U-CH1. Genes Chromosomes Cancer 32: 203-211. PubMed: 11579460.

Referências adicionais:

  • Scheipl S, Lohberger B, Rinner B, Froehlich EV, Beham A et al. (2013) Histone deacetylase inhibitors as potential therapeutic approaches for chordoma: an immunohistochemical and functional analysis. J Orthop Res 31(12):1999-2005. PubMed: 23893747.
  • Brüderlein S, Sommer J, Meltzer P, Li S, Osada T et al. (2010) Molecular Characterization of Putative Chordoma Cell Lines (Caracterização molecular de linhas celulares de cordoma putativo). Sarcoma: 630129. PubMed: 21253487.
  • Duan Z, Shen J, Yang X, Yang P, Osaka E et al. (2014) Prognostic significance of miRNA-1 (miR-1) expression in patients with chordoma. J Orthop Res. PubMed: 24501096.
  • Shalaby A, Presneau N, Ye H, Halai D, Berisha F, Idowu B et al. (2011) The role of epidermal growth factor receptor in chordoma pathogenesis: a potential therapeutic target. J Pathol 223(3):336-46. PubMed: 21171079.
  • Scheil-Bertram S, Kappler R, von Baer A, Hartwig E, Sarkar M et al. Molecular profiling of chordoma. Int J Oncol 44(4):1041-55. PubMed: 24452533.
  • Xia M, Huang R, Sakamuru S, Alcorta D, Cho MH et al. (2013) Identification of repurposed small molecule drugs for chordoma therapy. Cancer Biol Ther 14(7):638-47. PubMed: 23792643.
  • Duan Z, Choy E, Nielsen GP, Rosenberg A, Iafrate J et al. (2010) A expressão diferencial de microRNA (miRNA) em cordoma revela um papel para o miRNA-1 na expressão de Met. J Orthop Res 28(6):746-52. PubMed: 20041488.
  • Yang C, Hornicek F, Wood KB, Schwab JH, Choy E et al. (2010) Characterization and analysis of human chordoma cell lines (Caracterização e análise de linhas celulares de cordoma humano). Spine 35(13):1257-64. PubMed: 20461036.
  • Presneau N, Shalaby A, Ye H, Pillay N, Halai D, Idowu B et al. (2011) Role of the transcription factor T (brachyury) in the pathogenesis of sporadic chordoma: a genetic and functional-based study. J Pathol 223(3):327-35. PubMed: 21171078.